E.U.聯(lián)盟和布里塔利亞帝國(guó)曠日持久的戰(zhàn)爭(zhēng)在皇歷2010年發(fā)生轉(zhuǎn)機(jī),帝國(guó)派出壓倒性的兵力突襲遠(yuǎn)東日。在很短的時(shí)間內(nèi),日本這個(gè)國(guó)家不復(fù)存在,從此作為“11區(qū)”寫入歷史。舊日本人民流往世界各地,飽受歧視,心中滿是憤懣和不甘。2017年,E.U.聯(lián)軍132部隊(duì)向圣彼得堡挺進(jìn),但遭到帝國(guó)軍隊(duì)的圍困,面臨全軍覆沒的危險(xiǎn)。聯(lián)軍少校蕾拉·瑪露卡爾(坂本真綾 配音)將舊日本青年組成非正規(guī)軍W Zero部隊(duì),并提出以這支部隊(duì)營(yíng)救132部隊(duì)的建議。但是在最為兇險(xiǎn)的前線,他們不過肩負(fù)著犧牲自己來營(yíng)救友軍的悲哀命運(yùn)。慘烈的對(duì)決過后,W Zero部隊(duì)的中尉日向瑛斗(入野自由 配音)成功完成任務(wù)?! 《鴳?zhàn)爭(zhēng)還遠(yuǎn)遠(yuǎn)未曾結(jié)束,新的陰謀與危機(jī)浮出水面……